Karbapenem Dirençli Enterobacterales İzolatlarında Karbapenemaz Genlerinin Araştırılması: Dokuz Eylül Üniversitesi Hastanesi’nden İlk KPC Bildirimi
Şeyda Şilan Okalin1, Ayşe Nur Sarı Kaygısız1, Mahmut Cem Ergon2, İbrahim Mehmet Ali Öktem21Dokuz Eylül Üni̇versi̇tesi̇, Sağlık Bi̇li̇mleri̇ Ensti̇tüsü, Kli̇ni̇k Mi̇krobi̇yoloji̇ Ve Mi̇krobi̇yoloji̇2Dokuz Eylül Üni̇versi̇tesi̇, Tıp Fakültesi, Kli̇ni̇k Mi̇krobi̇yoloji̇ Ve Mi̇krobi̇yoloji̇
Amaç: Son yıllarda Enterobacterales bakterileri arasında artan karbapenem direnci tedavi seçeneklerini oldukça kısıtlamaktadır. Bu direncin temel mekanizması karbapenemaz enzimlerinin üretimidir. Bu çalışmanın amacı; hastanemizde yatan hastalardan izole edilen karbapeneme dirençli Enterobacterales izolatlarının karbapenemaz gen çeşitliliğinin araştırılması ve KPC geni bulunan izolatların klonal ilişkilerinin değerlendirilmesidir.
Yöntem: Ocak 2019-Mart 2019 tarihleri arasında; idrar, kan, trakeal aspirat, yara ve balgam örneklerinden izole edilmiş olan ve karbapenem grubundaki antibiyotiklerden en az birine dirençli, 48 Enterobacterales izolatı çalışmaya dâhil edilmiştir. Enterobacterales izolatlarının; üçü Escherichia coli ve 45’i Klebsiella pneumoniae’dir. Bu izolatlarda; OXA-48, NDM, KPC, IMP ve VIM karbapenemaz gen varlığı özgül primerler kullanılarak polimeraz zincir tepkimesi yöntemi ile araştırılmıştır. KPC geni taşıyan K. pneumoniae izolatları arasındaki klonal ilişkinin belirlenmesi amacıyla PFGE yöntemi kullanılmıştır.
Bulgular: Çalışma bulgularına göre üç E. coli izolatının ikisi blaOXA-48, biri blaKPC pozitif olarak tanımlanmıştır. Kırk beş K. pneumoniae izolatının ise 30’u yalnızca blaOXA-48, ikisi yalnızca blaNDM pozitif olarak bulunmuştur. K. pneumoniae izolatının yedisinde hem OXA-48 hem de NDM genleri tanımlanırken, geriye kalan altı K. pneumoniae izolatında yalnızca KPC gen pozitifliği bulunmuştur. IMP ve VIM karbapenemaz genleri çalışma izolatlarının hiçbirinde saptanmamıştır. KPC geni taşıyan K. pneumoniae izolatları arasındaki klonal ilişkinin araştırılması amacıyla yapılan PFGE analizinde dört izolatın aynı pulsotipe (A), diğer iki izolatın ise farklı pulsotiplere (B-C) ait olduğu görülmüştür.
Sonuç: Bu çalışma, yapılan literatür taramasından elde edilen verilere göre KPC karbapenemaz geninin, Dokuz Eylül Üniversitesi Hastanesi’nden bildirildiği ilk çalışmadır.
Investigation of Carbapenemase Genes in Carbapenem Resistant Enterobacterales Isolates: First KPC Report From Dokuz Eylul University Hospital
Şeyda Şilan Okalin1, Ayşe Nur Sarı Kaygısız1, Mahmut Cem Ergon2, İbrahim Mehmet Ali Öktem21Dokuz Eylül Uni̇versi̇ty, Institute Of Health Sciences, Clinical Microbiology And Microbiology2Dokuz Eylül University, Medical School, Clinical Microbiology And Microbiology
Objective: In recent years, increasing carbapenem resistance of Enterobacterales bacteria limits treatment options, considerably. The main mechanism of this resistance is the production of carbapenemase enzymes. The aim of this study is to determine carbapenemase gene types in Enterobacterales isolates from our hospitalized patients and assess the clonal associations of the isolates with KPC gene.
Method: A total of 48 clinical Enterobacterales isolates resistant to at least one carbapeneme and received between January 2019 and March 2019 were included in the study. Sample types were consisted of urine, blood, tracheal aspirate, wound and sputum. Of these isolates, three were Escherichia coli while 45 were Klebsiella pneumoniae. Types of carbapenemases were investigated by polymerase chain reaction, using specific primers for VIM, IMP, NDM, KPC and OXA-48 genes. PFGE was performed to determine the clonal associations between blaKPC positive K. pnemoniae isolates.
Results: According to the results, blaOXA-48 (n=2) and blaKPC (n=1) were found to be present among E. coli isolates. Regarding 45 K. pneumoniae isolates; only blaOXA-48 and only blaNDM were present in 30 and two isolates, respectively. Seven K. pneumoniae isolates were found positive for both blaOXA-48 and blaNDM. Remaining K. pneumoniae isolates (n=6) harboured only blaKPC. None of the isolates were positive for blaIMP and blaVIM. PFGE analysis showed four isolates had the same pulsotype (A), while two had different pulsotypes (B-C).
Conclusion: To our knowledge, this is the first report of KPC gene isolated in Dokuz Eylul University Hospital.
Sorumlu Yazar: İbrahim Mehmet Ali Öktem, Türkiye
| ARAÇLAR |
 Tam Metin PDF Yazdır Alıntıyı İndir RIS EndNote BibTex Medlars Procite Reference Manager E-Postala Paylaş Yazara e-posta gönder
Benzer makaleler Google Scholar |