Tüberkülozlu Hastalara Ait Mycobacterium tuberculosis Kompleks İzolatlarının MIRU-VNTR ve Spoligotiplendirme Yöntemleri ile Genotiplendirilmesi
Nurcihan Biltekin1, Mahmut Ülger1, Mediha Begüm Kayar2, Gülfer Yakıcı2, Seda Tezcan Ülger3, Gönül Aslan3, Nuran Delialioğlu3, Fatih Köksal41Mersin Üniversitesi, Eczacılık Fakültesi, Farmasötik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Mersin, Türkiye2Gaziantep İslam Bilim ve Teknoloji Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Gaziantep, Türkiye
3Mersin Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Mersin, Türkiye
4Çukurova Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Adana, Türkiye
GİRİŞ ve AMAÇ: Tüberküloz, tüm dünyada görülen önemli mortalite ve morbidite ile sonuçlanan, tek bir enfeksiyöz ajanının neden olduğu bakteriyel bir hastalıktır. Tüberküloz basili ile dünya nüfusunun neredeyse dörtte biri enfektedir ve bu hastalıktan dolayı her yıl yaklaşık iki milyon kişi ölmektedir. Bu çalışmada ilimizdeki Mycobacterium tuberculosis kompleks (MTK) izolatlarının genotiplendirilmesi ve bu izolatlara ait moleküler epidemiyolojik verilerinin elde edilmesi amaçlanmıştır.
YÖNTEM ve GEREÇLER: Çalışmada Mersin Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı Mikobakteriyoloji Laboratuvarı’ndaki 103 MTK izolatının MIRU-VNTR ve spoligotiplendirme yöntemleri ile genotiplendirilmesi yapıldı.
BULGULAR: Moleküler genotiplendirme sonucunda 103 izolatın 10 spoligotiplendirme kümesi içerisinde dağıldığı görüldü. T ailesinin 48 (%46.6) izolat ile en büyük kümeyi oluşturduğu belirlendi. Bunu 16 (%15.5) izolat ile Haarlem ailesinin, 13 (%12.6) izolat ile TUR ailesinin, 10 (%9.7) izolat ile S ailesinin, dörder (%3.9) izolat ile Beijing ve LAM ailelerinin, üçer (%2.9) izolat ile Bovis ve NEW-1 ailelerinin, birer (%0.9) izolat ile Delhi/CAS ve H37Rv ailelerinin izlediği görüldü.
TARTIŞMA ve SONUÇ: Çalışma sonucunda, en yaygın görülen ailenin %46.6 oranıyla T ailesi olduğu tespit edildi. Daha önce yapılan çalışmalarda özellikle çok ilaca dirençli tüberküloz ile ilişkili olduğu bildirilen Beijing ailesi de artık bölgemizde saptanmıştır. MIRU-VNTR ve spoligotiplendirme yöntemlerinin kombinasyonu ile M. tuberculosis’in, moleküler epidemiyolojik çalışmaların yapıldığı bölgedeki hareketliliğinin izlenmesi ile o bölgedeki popülasyonda tüberkülozun kontrolünde ve eliminasyonunda yararlı olacağı düşünülmektedir.
Genotyping of Mycobacterium tuberculosis Complex Isolates from Patients with Tuberculosis by MIRU-VNTR and Spoligotyping Methods
Nurcihan Biltekin1, Mahmut Ülger1, Mediha Begüm Kayar2, Gülfer Yakıcı2, Seda Tezcan Ülger3, Gönül Aslan3, Nuran Delialioğlu3, Fatih Köksal41Mersin University, Faculty of Pharmacy, Department of Pharmaceutical Microbiology, Mersin, Türkiye2Gaziantep Islam Science and Technology University, Faculty of Medicine, Department of Medical Microbiology, Gaziantep, Türkiye
3Mersin University, Faculty of Medicine, Department of Medical Microbiology, Mersin, Türkiye
4Çukurova University, Faculty of Medicine, Department of Medical Microbiology, Adana, Türkiye
INTRODUCTION: Tuberculosis is a bacterial disease caused by a single infectious agent, resulting in significant mortality and morbidity worldwide. Almost a quarter of the world’s population is infected with tuberculosis bacillus, and about two million people die each year from this disease. In this study, it was aimed to genotyping Mycobacterium tuberculosis compleks (MT) isolates in our province and to obtain molecular epidemiological data of these isolates.
METHODS: In the study, genotyping of 103 MTC isolates in the Mersin University Faculty of Medicine Department of Medical Microbiology Mycobacteriology Laboratory was performed using spoligotyping and MIRU-VNTR methods.
RESULTS: As a result of molecular genotyping, it was observed that 103 isolates were distributed in 10 spoligotyping clusters. It was determined that the T family constituted the largest cluster with 48 (46.6%) isolates. This was followed by 16 (15.5%) isolates of the Haarlem family, 13 (12.6%) isolates of the TUR family, 10 (9.7%) isolates of the S family, four (3.9%) isolates of the Beijing and LAM families, three (2.9%) isolates of the Bovis and NEW-1 families were followed by Delhi/CAS and H37Rv families, with one (0.9%) isolate.
DISCUSSION AND CONCLUSION: As a result of the study, it was determined that the most common family was the T family with a rate of 46.6%. The Beijing family, which was reported to be associated with multi-drug resistant tuberculosis in previous studies, has now been identified in our region. It is thought that the combination of MIRU-VNTR and spoligotyping methods will be useful in the control and elimination of tuberculosis in the population in that region by monitoring the motility of M. tuberculosis in the region where molecular epidemiological studies are carried out.
Sorumlu Yazar: Nurcihan Biltekin, Türkiye
| ARAÇLAR |
 Tam Metin PDF Yazdır Alıntıyı İndir RIS EndNote BibTex Medlars Procite Reference Manager E-Postala Paylaş Yazara e-posta gönder
Benzer makaleler Google Scholar |