Ağız Çalkantı Suyunda Candida Türlerinin Belirlenmesinde Real-Time PCR Testinin Tanı Değeri
Petek Çürük1, Ayşe Sultan Karakoyun1, Nevzat Ünal2, Şehnaz Yılmaz3, M. Emre Benlidayı4, Ertan Kara5, M. Macit İlkit11Çukurova Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Mikoloji Bilim Dalı, Adana, Türkiye2Sağlık Bilimleri Üniversitesi, Adana Şehir Eğitim ve Araştırma Hastanesi, Mikrobiyoloji Laboratuvarı, Adana, Türkiye
3Çukurova Üniversitesi Diş Hekimliği Fakültesi, Endodonti Anabilim Dalı, Adana, Türkiye
4Çukurova Üniversitesi Diş Hekimliği Fakültesi, Ağız, Diş ve Çene Cerrahisi Anabilim Dalı, Adana, Türkiye
5Çukurova Üniversitesi Tıp Fakültesi, Halk Sağlığı Anabilim Dalı, Adana, Türkiye
GİRİŞ ve AMAÇ: Sağlıklı insanların ağız florasında maya mantarları da dahil olmak üzere birçok mikroorganizma bulunur. Bu denge halinin bozulması maya mantarlarının kolonizasyonuna veya ağız içi kandidoza sebep olabilir. Sunulan çalışmada, ağız florasında tıbbi önemi olan Candida türlerinin tanımlanması için real-time PCR (RT-PCR) yönteminin tanı değerinin belirlenmesi amaçlanmıştır.
YÖNTEM ve GEREÇLER: Çukurova Üniversitesi Diş Hekimliği Fakültesinden 200 öğrenci çalışmaya dahil edildi. Katılımcılardan alınan konsantre ağız çalkantı suyu örnekleri steril eküvyonlu çubuk ile CHROMAgar Candida (CAC) besiyerine inoküle edildi. İzole edilen Candida türlerinin identifikasyonunda CAC, RT-PCR ve MALDI-TOF MS yöntemleri kullanıldı.
BULGULAR: Toplam 52 (%26) klinik örnekten 68 maya mantarı izole edildi. En sık izole edilen türler, sıklığa göre, C. albicans (%36.1), C. parapsilosis (%21.3), C. dubliniensis (%14.7), C. lusitaniae (%9.8), C. kefyr (%8.2), C. lambica (%3.3) ve %6.6 diğer Candida türleri idi. Ağız içi mantar kolonizasyonu kullanılan diş macunu markası ile ilişkili bulundu (p = 0.02). Çalışmada izole edilen Candida türlerinden C. albicans, C. kefyr ve C. lambica dışındaki türler RT-PCR’ı takiben erime sıcaklığı analizi (MCA) ile belirlendi. Ancak, C. albicans ve C. kefyr, erime sıcaklıklarına (melting tempature, Tm) göre birbirinden ayırt edilemedi.
TARTIŞMA ve SONUÇ: Candida türlerinin geleneksel yöntemler ile belirlenmesi ve birbirinden ayırt edilmesi 2–3 gün sürebilmektedir. İzole edilen Candida türlerinin RT-PCR analizini takiben MCA ile tanımlanması basit, ucuz ve çabuk bir yöntemdir. Ancak, çalışmada RT-PCR’ın Candida türlerinin kesin tanısı için (C. albicans, C. kefyr ve C. lambica) yeterli olmadığı görüldü.
Diagnostic Value of The Real-Time PCR Test for The Identification of Candida Species in Oral Rinse Solutions
Petek Çürük1, Ayşe Sultan Karakoyun1, Nevzat Ünal2, Şehnaz Yılmaz3, M. Emre Benlidayı4, Ertan Kara5, M. Macit İlkit11Division of Mycology, Department of Microbiology, Faculty of Medicine, University of Çukurova, Adana, Türkiye2Laboratory of Medical Microbiology, Adana City Training and Research Hospital, University of Health Sciences, Adana, Türkiye
3Department of Endodontics, Faculty of Dentistry, Cukurova University, Adana, Türkiye
4Department of Oral and Maxillofacial Surgery, Faculty of Dentistry, University of Çukurova, Adana, Türkiye
5Department of Public Health, Faculty of Medicine, University of Çukurova, Adana, Türkiye
INTRODUCTION: A variety of microorganisms are found in the oral cavities of healthy humans, including yeast fungi. Disruption of the balance among these microorganisms may cause excessive yeast colonization, or oral candidosis. In the present study, we aimed to investigate the diagnostic value of a real-time PCR method for the identification of medically important Candida species in the oral flora.
METHODS: Two hundred students from Çukurova University Faculty of Dentistry participated in this study. The concentrated oral rinse water samples from the participants were inoculated into CHROMagar Candida (CAC) medium with a swab. CAC along with RT-PCR and MALDI-TOF MS were used to identify the Candida species.
RESULTS: A total of 68 yeast fungi were isolated from 52 (26%) clinical samples. The most common isolated species were C. albicans (36.1%), C. parapsilosis (21.3%), C. dubliniensis (14.7%), C. lusitaniae (9.8%), C. kefyr (8.2%), C. lambica (3.3%) and other Candida species (6.6%). Oral colonisation of yeast fungi was associated with the toothpaste brand (p=0.02). The Candida species isolated in this study were reliably identified by RT-PCR melting curve analysis (MCA), except C. albicans, C. kefyr and C. lambica. However, this method could not distinguish C. albicans and C. kefyr based on their peak melting temperatures (Tm).
DISCUSSION AND CONCLUSION: It may take 2–3 days for Candida species to be identified and differentiated from each other using conventional methods. MCA of Candida species using RT-PCR, which can be accomplished in a single day, is a simple, inexpensive, and rapid method. However, this study revealed that RT-PCR was not reliable in the identification of Candida species (C. albicans, C. kefyr, and C. lambica).
Sorumlu Yazar: M. Macit İlkit, Türkiye
| ARAÇLAR |
 Tam Metin PDF Yazdır Alıntıyı İndir RIS EndNote BibTex Medlars Procite Reference Manager E-Postala Paylaş Yazara e-posta gönder
Benzer makaleler Google Scholar |