İmmünsüprese Hastalarda Gerçek Zamanlı Polimeraz Zincir Reaksiyonu (Real-Time PCR) ile BKV ve JCV DNA Pozitifliğinin Araştırılması
Meryem Çolak1, Aylin Altay1, Yasemin Erten2, Zübeyde Nur Özkurt3, Seçil Özkan4, Ahmet Pınar5, Gülendam Bozdayı11Gazi Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Beşevler, Ankara2Gazi Üniversitesi Tıp Fakültesi, Nefroloji Bilim Dalı, Beşevler, Ankara
3Gazi Üniversitesi Tıp Fakültesi, Hematoloji Bilim Dalı, Beşevler, Ankara
4Gazi Üniversitesi Tıp Fakültesi, Halk Sağlığı Anabilim Dalı, Beşevler, Ankara
5Hacettepe Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Ankara
GİRİŞ ve AMAÇ: BK virüs (BKV) ve JC virüs (JCV) DNA pozitifliğinin risk grubunda olan hastalarda gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu (Real-Time PCR) ile retrospektif olarak araştırılması amaçlanmıştır.
YÖNTEM ve GEREÇLER: Çalışmaya 2014 Mart-2015 Mayıs tarihleri arasında Gazi Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi Moleküler Mikrobiyoloji Laboratuvarı’na gönderilen 129 hastaya ait, toplam 296 örnek dâhil edilmiştir. Klinik örneklerden nükleik asit izolasyonu “MagNA-Pure Compact Nucleic Acid Isolation” (Roche, Almanya) kiti kullanılarak yapılmıştır. Viral DNA amplifikasyonu JCV ve BKV primer dizilerini içeren amplifikasyon karışımı “LightMix® BK/JC Polyomavirus Detection” (TIB-Molbiol GmbH, Almanya) kiti ile LightCycler® 2.0 (Roche, Almanya) cihazında yapılmıştır.
BULGULAR: Çalışılan örneklerde %35.4 (105/296) BKV ve JCV DNA pozitifliği tespit edilmiştir. İdrar örneklerinin %56.5 (26/46)’inde BKV, %10.8 (5/46)’inde JCV DNA varlığı saptanmıştır. Kan örneklerinde %29.2 (73/250) BKV, %3.2 (8/250) JCV, %2.4 (6/250) hem BKV hem de JCV DNA’sı saptanmıştır. BKV ve JCV pozitiflik oranlarının örneklerin gönderildiği kliniklere göre dağılımı, kemik iliği transplantasyon ünitesi %59.6 ve %13.4,
çocuk nefroloji %32.4 ve %1.2, erişkin nefroloji %16.8 ve %2.9’dur. Erişkin ve çocuk hematoloji servislerinden gelen örneklerde sırasıyla %78.5 (11/14) ve %57.1 (8/14) BKV pozitifliği, çocuk hematolojide bir hastada BKV ve JCV pozitifliği tespit edilmiştir. Erişkin hematoloji servisinden gelen örneklerde JCV pozitifliği bulunmamıştır. Çalışılan örneklerin %25.2 (25/99)’sinde BKV DNA ≥104 kopya/ml olarak tespit edilmiş olup, bu örneklerin
%80 (20/25)’inin idrar olduğu görülmüştür.
TARTIŞMA ve SONUÇ: Böbrek transplant hastalarında BKV riskinin artması nedeniyle BKV’ün gerçek zamanlı PZR ile izlenmesi oldukça önemlidir. Yapılan birçok çalışmada, BKV yükü böbrek transplantasyonu sonrası greft fonksiyon bozukluğu ve organ reddi ile ilişkili bulunmuştur. Gerçek zamanlı PZR ile BKV nefropatisinin düzenli olarak takibi ve kantitasyon verilmesi sayesinde, transplantasyon sonrası organ kayıpları belirgin oranda azalacaktır.
Investigation of BK and JC Virus DNA Positivities by Real-Time Polymerase Chain Reaction in Immunosuppressive Patients
Meryem Çolak1, Aylin Altay1, Yasemin Erten2, Zübeyde Nur Özkurt3, Seçil Özkan4, Ahmet Pınar5, Gülendam Bozdayı11Gazi University Faculty of Medicine, Department of Medical Microbiology, Beşevler, Ankara2Gazi University Faculty of Medicine, Department of Nephrology, Beşevler, Ankara
3Gazi University Faculty of Medicine, Department of Hematology, Beşevler, Ankara
4Gazi University Faculty of Medicine, Department of Public Health, Beşevler, Ankara
5Hacettepe University Faculty of Medicine, Department of Medical Microbiology, Ankara
INTRODUCTION: This study was aimed to investigate the BK virus (BKV) and JC virus (JCV) DNA by real-time polymerase chain reaction (Real-Time PCR) in immunosuppressive patients with high risk.
METHODS: A total of 296 samples obtained from 129 patients hospitalized in Gazi University Hospital, Ankara, Turkey between March 2014-May 2015 were included in the study. Viral DNA was extracted by the “MagNA-Pure Compact NucleicAcid Isolation Kit” (Roche, Germany). By using amplification mix LightMix® BK/JC Polyomavirus Detection Kit (TIB-Molbiol, Germany) that included primers targeting JCV
and BKV, nucleic acids were amplified with LightCycler® 2.0 (Roche, Germany).
RESULTS: BKV-JCV positivity rate was found as 35.4% (105/296). In urine samples the rate of positivity was 56.5% (26/46) for BKV and
10.8% (5/46) for JCV. In blood samples the rate of positivity were 29.2% (73/250) for BKV, 3.2% (8/250) for JCV. The distribution of
the units with BKV-JCV positive patients, respectively, were as follows: 59.6%-13.4% from the bone marrow transplantation unit,
32.4%-1.2% from paediatric nephrology, 16.8%-2.9% from nephrology. BKV positivity rate was 78.5% (11/14) in adult haematology and 57.1% (8/14) in paediatric haematology. One patient from paediatric haematology revealed both BKV and JCV positivity. There were no JCV positivity in patients followed at the adult haematology unit. In 25.2% (25/99) of the samples, BKVDNA was detected ≥104 copies/ml and 80% (20/25) of those samples were urine.
DISCUSSION AND CONCLUSION: Monitorization of BKV by Real-Time PCR in kidney transplant patients is of crucial importance since high quantities of BKV is associated with graft dysfunction and organ rejection following transplantation. Follow-up of BKV nephropathy through BKV quantitation by real-time PCR, may help to decrease the detrimental effects on transplant outcome.
Sorumlu Yazar: Gülendam Bozdayı, Türkiye
| ARAÇLAR |
 Tam Metin PDF Yazdır Alıntıyı İndir RIS EndNote BibTex Medlars Procite Reference Manager E-Postala Paylaş Yazara e-posta gönder
Benzer makaleler Google Scholar |