Kandidemilerin Hızlı Tanı ve İdentifikasyonunda Direkt Kan Kültür Şişesinden MALDI-TOF MS Yöntemi ve Germ Tüp Testinin Kıyaslanması
Kerem Yılmaz1, Nurten Altanlar21Soma Devlet Hastanesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarı, Manisa2Ankara Üniversitesi Eczacılık Fakültesi, Farmasötik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Anakara
GİRİŞ ve AMAÇ: Kandidemi, insidansı gün geçtikçe yükselen, mortalitesi oldukça yüksek bir enfeksiyondur. Kandidemi kliniğinden en sık sorumlu mikroorganizma sıklıkla Candida albicans'tır. Fakat diğer türler de önem taşımaktadır.. Bu nedenle mantar enfeksiyonlarında erken tanıyı sağlamak ve mortalite oranını düşürmek için kısa sürede ve güvenilir sonuç veren yöntemlere ihtiyaç duyulmaktadır. Bu çalışmamızın amacı çok daha kısa sürede etkenin identifikasyonunda otomatize/manuel birkaç yöntemin değerlendirilmesi ve karşılaştırılmasıdır.
YÖNTEM ve GEREÇLER: Araştırmada, pozitif kan kültürlerinden izole edilen 50 Candida suşunun kan kültür sisteminde pozitifleşme süre (KKP) ortalamaları türlere göre tespit edilmiştir. Tüm örneklere direkt kan kültür şişesinden germ tüp testi ve MALDI-TOF MS ile identifikasyon, saf kültür eldesi sonarası kültürden germ tüp testi ve MALDI-TOF MS ile identifikasyon işlemi yapılmıştır. Elde edilen veriler karşılaştırmalı olarak değerlendirilmiştir.
BULGULAR: Kan kültür sisteminde pozitifleşme süre ortalamaları olarak türlere göre; C. albicans 36,1 s, C. parapsilosis 39,4 s, C. tropicalis 17,7 s, C. glabrata 50,5 s olarak belirlenmiştir. Germ tüp testi ile direkt kan kültür şişesinden ve saf kültür eldesi sonrası yapılan işlemlerde 49 kökende (%98) uyum bulunmuştur. 50 adet Candida türünün MALDI-TOF yöntemi iledirekt kan kültür şişesinden ve saf kültür eldesi sonrası yapılan identifikasyon işlemlerinde 37 kökende (%74) uyum bulunmuştur.
TARTIŞMA ve SONUÇ: KKP süreleri, kandidemili hastalar arasında nihai tür tanımlanmasından önce tür tahminine yönelik bir ipucu olabilir. Direkt GTT, albicans/non-albicans Candida türleri ayrımında kültürden bir gün önce tespitine yüksek doğruluk oranıyla olanak sağlamaktadır. 37 Candida türünde standart yöntemlerle %100 uyumlu olacak şekilde tanımlama yapılmış ve bu yöntemin saf kültür eldesi gerektiren MALDI-TOF MS yöntemine göre en az 48 saat avantaj sağladığı görülmüştür.
Comparison of MALDI-TOF MS Method Using Samples From Blood Culture Bottles and Germ Tube Test in Rapid Detection and Identification of Candidemia
Kerem Yılmaz1, Nurten Altanlar21Soma State Hospital, Medical Microbiology Laboratory, Manisa, Turkey2Ankara University Faculty of Pharmacy, Department of Pharmaceutical Microbiology, Anakara, Turkey
INTRODUCTION: Candidemia is an increasing in prevalence infection with a high mortality. Candida albicans is the most common factor in candidemia but other species are also important. In treatment of Candida infections, rapid treatment is extremely important for patients as much as performing identification on species level. Identification period is very important for the selection of the appropriate treatment because of the existing antifungal resistance in non-Candida albicans species. Therefore, in order to provide early diagnosis in fungal infections and decrease the mortality rate, methods which provide reliable results in a short time are needed.
The objective of this study is to evaluate and compare several automated/manual methods in identification of the factor in a much shorter time.
METHODS: In the study, average time to become positive in blood culture system for 50 Candida strains which were isolated from positive blood cultures sent to Sakarya University Training and Research Hospital Medical Microbiology Laboratory between March 2018 and March 2019 was determined according to the species. All samples were applied germ tube test and identification with MALDI-TOF MS directly from blood culture bottle, after obtaining pure culture, culture was applied germ tube test and identification with MALDI-TOF MS. The data obtained was evaluated comparatively.
RESULTS: In the study, average time to get positive in blood culture system in terms of species was determined to be 36,1 h for C. albicans, 39,4 h for C. parapsilosis, 17,7 h for C. tropicalis, 50,5 h for C. glabrata. In the processes performed after germ tube test from direct blood culture bottle and obtaining of pure culture, compatibility was found in 49 roots (98%). Identification results according to MALDI TOF MS method from direct blood culture bottle for 50 Candida species analyzed in our study was found to be; 20 for C. albicans, 8 for C. parapsilosis, 7 for C. tropicalis and 2 for C. glabrata. According to MALDI-TOF MS method after obtaining pure culture, it was identified as follows; 25 for C. albicans, 12 for C. parapsilosis, 10 for C. tropicalis and 3 for C. glabrata. In the identification processes performed after MALDI-TOF method from direct blood culture bottle and obtaining of pure culture, compatibility was found in 37 roots (74%). It was observed that unidentified samples were due to spectrum deficiency, not due to false identification.
DISCUSSION AND CONCLUSION: Time to get positive in blood culture may be a clue for prediction of species before final species identification among patients with candidemia. Direct GTT enables the detection of albicans/non-albicans Candida species the day before the culture with high accuracy. Thirty-seven Candida species were identified to be 100% compatible with standard methods, and this method was shown to provide at least 48 hours advantage over the MALDI-TOF MS method, that requires pure culture yield.
Sorumlu Yazar: Kerem Yılmaz, Türkiye
| ARAÇLAR |
 Tam Metin PDF Yazdır Alıntıyı İndir RIS EndNote BibTex Medlars Procite Reference Manager E-Postala Paylaş Yazara e-posta gönder
Benzer makaleler Google Scholar |