Alt Solunum Yolu Enfeksiyonu Olan Çocuklarda Solunum Sinsityal Virüs’ün Saptanması ve Moleküler Analizi
İmran Sağlık1, Dilek Çolak2, Derya Mutlu2, Rabia Can Sarınoğlu3, Dilara İnan4, Nurgül Günay5, Gözde Öngut2, Nihal Oygür6, oguz dursun61Bursa Uludağ Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı,Bursa2Akdeniz Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı,Antalya
3Marmara Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı,İstanbul
4Akdeniz Üniversitesi Tıp Fakültesi, Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı,Antalya
5Akdeniz Üniversitesi Hastanesi, Enfeksiyon Kontrol Komitesi,Antalya
6Akdeniz Üniversitesi Tıp Fakültesi, Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Anabilim Dalı,Antalya
GİRİŞ ve AMAÇ: Bu çalışma, ASYE nedeniyle hastanemizde tedavi gören çocuk hastalardan saptanan RSV suşlarının genotipini belirlemek ve moleküler ilişkilerini değerlendirmek amacıyla yapılmıştır.
YÖNTEM ve GEREÇLER: Aralık 2012-Mayıs 2013 tarihlerinde,.........................’nde ASYE olan 72 hastadan nazofarengeal sürüntü alınmıştır. Gerçek-zamanlı PCR (RealStar RSV RT-PCR, Altona Diagnostics) yöntemiyle 28 RSV A ve bir RSV B izole edilmiş; RSV A suşlarının 20’sinin RSV G geninin bir bölümüne dizi analizi uygulanmıştır. Nükleotid dizileri ClustalX programı (sürüm 2.1) ile analiz edilmiştir. Filogenetik ağaç MEGA (sürüm 6.06) yazılımı kullanılarak neighbor-joining yöntemiyle oluşturulmuştur.
BULGULAR: Hastaların ortanca yaşı 35 gün (8–6061) olarak belirlenmiştir. Dizi analizi yapılan 20 izolat RSV A genotip GA2 olarak tiplendirilmiştir. Onbir RSV A izolatı birbiri ile identik bulunmuş; bunların altısının hastane kaynaklı beşinin ise toplum kaynaklı RSV enfeksiyonu olduğu belirlenmiştir. İdentik olan ve nozokomiyal enfeksiyon düşünülen altı hastanın dördünün yenidoğan yoğun bakım ünitesinde (prematür), birinin yenidoğan kliniğinde, birinin ise pediatrik hematoloji onkolojik kliniği’nde olduğu tespit edilmiştir. Enfeksiyonun tespitiyle standart izolasyon önlemleri gözden geçirilmiş ve virüsün yayılması önlenmiştir.
Dizileme yapılan tüm hastalar bölgemizde yaşamaktaydı. Toplum kaynaklı enfeksiyonu olan hastalardan beşinin identik suşla enfekte olduğu ancak dokuz hastanın bunlardan filogenetik olarak farklı suşlarla enfekte olduğu görülmüştür.
TARTIŞMA ve SONUÇ: Hastanemizde çocuklarda nozokomiyal ve toplum kaynaklı RSV A enfeksiyonlarına yol açan suşlar GA2 alt tipindedir. Bölgemizde toplum kaynaklı enfeksiyonlarda identik suşlar saptanmış ve bu suşlar nozokomiyal enfeksiyonlara da yol açmıştır. Nozokomiyal enfeksiyon açısından riskli kliniklerde RSV enfeksiyonlarının sıklığının takibi, moleküler mikrobiyolojik analizlerin yapılması ve standart izolasyon önlemlerinin uygulanması önemlidir.
Determination and Molecular Analysis of Respiratory Syncytial Virus In Children With Lower Respiratory Track Infections
İmran Sağlık1, Dilek Çolak2, Derya Mutlu2, Rabia Can Sarınoğlu3, Dilara İnan4, Nurgül Günay5, Gözde Öngut2, Nihal Oygür6, oguz dursun61Bursa Uludag University Faculty of Medicine, Department of Medical Microbiology,Bursa2Akdeniz University Faculty of Medicine, Department of Medical Microbiology,Antalya
3Marmara University Faculty of Medicine, Department of Medical Microbiology,İstanbul
4Akdeniz University Faculty of Medicine, Department of Infectious Diseases and Clinical Microbiology,Antalya
5Akdeniz University Hopital, Infection Control Committee,Antalya
6Akdeniz University Faculty of Medicine, Department of Child Health and Diseases,Antalya
INTRODUCTION: This study aimed to define the genotype of RSV strains in pediatric patients with Lower Respiratory Track Infections (LRTI) and to evaluate their molecular relationships.
METHODS: Nasopharyngeal swab samples were obtained from 72 patients with LRTI between December 2012 and May 2013 in the Pediatric Health and Diseases Department of............... Hospital. Twenty eight RSV A and one RSV B isolates were obtained by real-time PCR (RealStar RSV RT-PCR, Altona Diagnostics) method. The part of the G gene was sequenced for genotyping of 20 RSV A strains. Nucleotide sequences were analyzed with the ClustalX program (version 2.1). The phylogenetic tree was constructed by the using the MEGA (version 6.06) software.
RESULTS: The median age of patients were 35 days (range: 8–6061). All isolates of RSV A were identified as genotype GA2. Eleven isolates were identical; six of them were hospital-acquired and five were community-acquired RSV infections. Six patients were considered to have nosocomial infections, four of them were in the Neonatal Intensive Care Unit (premature), one was in the Neonatal Clinic and one was in the Pediatric Hematology-Oncology Clinic. Five of the eleven identical isolates were identified from patients with community-acquired infections.
DISCUSSION AND CONCLUSION: Nosocomial and community-acquired RSV infections are RSV A GA2 subtype in our hospital. Identical strains can be detected in community acquired infections in the same region; these strains can also cause nosocomial infections. Monitoring of RSV infections, detecting of genotype with molecular microbiological analysis and applied standard isolation precautions is important in clinics at increased risk for nosocomial infections.
Sorumlu Yazar: İmran Sağlık, Türkiye
| ARAÇLAR |
 Tam Metin PDF Yazdır Alıntıyı İndir RIS EndNote BibTex Medlars Procite Reference Manager E-Postala Paylaş Yazara e-posta gönder
Benzer makaleler Google Scholar |