Karbapenem Dirençli Klebsiella pneumoniae İzolatlarında Karbapenemaz Saptanmasında Karbapenemaz İnaktivasyon Testinin Kullanımı
Tayfur Demiray1, Özlem Aydemir1, Ümit Kılıç2, Kerem Yılmaz2, Mehmet Köroğlu2, Mustafa Altındiş21Sakarya Üniversitesi Eğitim ve Araştırma Hastanesi, Klinik Mikrobiyoloji Laboratuvarı, Sakarya2Sakarya Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı, Sakarya
GİRİŞ ve AMAÇ: Karbapenemaz üreten Enterobacteriaceae izolatlarının neden olduğu enfeksiyonlar tüm dünyada olduğu gibi ülkemizde de en güncel sağlık problemlerindendir. Karbapenem dirençli Klebsiella türlerinin neden olduğu salgınlar ve sporadik vakalar ülkemizde giderek artan sıklıkta rapor edilmeye başlanmıştır. Bu çalışmada moleküler metot ile karbapenemaz ürettiği doğrulanmış K. pneumoniae izolatlarında karbapenemaz inaktivasyon testinin tanısal değerinin modifiye Hodge testi ile kıyaslanması ve rutin laboratuvar pratiğinde kullanımının irdelenmesi amaçlanmıştır.
YÖNTEM ve GEREÇLER: Hastanemizde 2014-2015 yılları arasında klinik örneklerden ve tarama numunelerinden izole edilen toplam 125 Klebsiella pneumoniae izolatı çalışma kapsamında değerlendirildi. Modifiye Hodge testi ve karbapenemaz inaktivasyon testinin değerlendirilmesi için karbapenemaz üreten karbapenem dirençli 60 izolat ve karbapenem duyarlı 60 izolat kullanıldı. Moleküler değerlendirme Gene-Xpert® sistemine ait Carba R kitleri (Cepheid, ABD) ile blaIMP-1, blaKPC, blaNDM-1,blaOXA-48 ve blaVIM gen bölgeleri araştırılarak yapıldı.
BULGULAR: Moleküler yöntem ile karbapenemaz kodlayan gen varlığı saptanan 60 Klebsiella izolatında modifiye Hogde testi ile 54 adet izolatta pozitif sonuç saptanırken, karbapenemaz inaktivasyon testinde 52 adet izolatta pozitiflik saptandı.
TARTIŞMA ve SONUÇ: Moleküler yöntem altın standart olarak değerlendirildiğinde; modifiye Hodge testinin ve karbapenemaz inaktivasyon testlerinin duyarlılıkları sırasıyla 0,85 ve 0,80; özgüllükleri ise 0,95 ve 0,93 olarak hesaplanmıştır. Enzim inhibisyonuna bağlı fenotipik testler düşük maliyetli ve kolay uygulanabilir olmaları nedeniyle rutin uygulamalarda tercih edilebilmektedirler. Ancak bu testlerin duyarlılık ve özgüllüklerinin değişken olduğu unutulmamalıdır
Use of Carbapenemase Inactivation Test in Detection of Carbapenemase Production among The Isolates of Carbapenem Resistant Klebsiella pneumoniae
Tayfur Demiray1, Özlem Aydemir1, Ümit Kılıç2, Kerem Yılmaz2, Mehmet Köroğlu2, Mustafa Altındiş21Sakarya University Training and Research Hospital, Clinical Microbiology Laboratory, Sakarya, Turkey2Sakarya University Faculty of Medicine, Department of Clinical Microbiology, Sakarya, Turkey
INTRODUCTION: The infections caused by carbapenemase-producing Enterobacteriaceae isolates are the one of the most actual health problems in our country as well as all over the world. Epidemics and sporadic cases caused by carbapenem resistant Klebsiella species have begun to be reported increasingly from our country. In this study, we aimed to compare the diagnostic value of carbapenemase inactivation test with the modified Hodge test and to evaulate the use of carbapenemase inactivation test in routine laboratory practice in carbapenemase-producing K. pneumoniae isolates verified by molecular method.
METHODS: A total of 125 isolates of Klebsiella pneumoniae isolated from clinical specimens and screening specimens between 2014 and 2015 were evaluated. Carbapenemase-producing 60 isolates and carbapenem sensitive 60 isolates were used for evaluation of the modified Hodge test and carbapenemase inactivation test. Molecular evaluation was performed by investigating the blaIMP-1, blaKPC, blaNDM-1,blaOXA-48 and blaVIM gene regions with Carba R kits (Cepheid, USA) of the Gene-Xpert® system.
RESULTS: The modified Hogde test detected 54 out of 60 Klebsiella isolates, which were found to have carbapenemase encoding gene by molecular method; whereas carbapenemase inactivation test detected 52 isolates out of 60.
DISCUSSION AND CONCLUSION: When molecular method is regarded as gold standard, sensitivities of modified Hodge test and carbapenemase inactivation test were 0,85 and 0,80; specificities were calculated as 0,95 and 0,93, respectively. Phenotypic tests depending on enzyme inhibition can be preferred in routine practice since they have low cost and are easy-to-apply. However, it should not be forgotten that the sensitivity and specificity of these tests are variable.
Sorumlu Yazar: Tayfur Demiray, Türkiye
| ARAÇLAR |
 Tam Metin PDF Yazdır Alıntıyı İndir RIS EndNote BibTex Medlars Procite Reference Manager E-Postala Paylaş Yazara e-posta gönder
Benzer makaleler Google Scholar |