Mycobacterium tuberculosis kompleks ve Rifampisin Direncinin Saptanmasında Hızlı Moleküler Yöntemle Konvansiyonel Yöntemlerin Karşılaştırılması
Emre Özkarataş1, Müge Hacer Özkarataş2, Ayşe Aydan Özkütük2, Nuran Esen21Çukurova Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı, Temel İmmünoloji Bilim Dalı, Adana2Dokuz Eylül Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı, İzmir
GİRİŞ ve AMAÇ: Bu çalışmada, Haziran 2012- Kasım 2016 tarihleri arasında Dokuz Eylül Üniversitesi Hastanesi Merkez Laboratuvarı’nda kullanılan GeneXpert MTB/RIF (GX) testinin Mycobacterium tuberculosis kompleks (MTK) tanısı ve rifampisin (RIF) direncinin saptanmasındaki performansının mikroskobi ve kültür yöntemleriyle karşılaştırılarak değerlendirilmesi amaçlanmıştır
YÖNTEM ve GEREÇLER: Klinik istem doğrultusunda Kinyoun boyalı mikroskobik inceleme ve kültür yöntemleriyle birlikte GX testi çalışılan 4199 hasta örneğinin (1361 akciğer, 2838 akciğer dışı örnek) sonuçları retrospektif olarak çalışmaya alınmıştır.
BULGULAR: MTK saptanmasında kültür referans yöntem alınarak; GX testinin duyarlılığı ve özgüllüğü sırasıyla; tüm örneklerde %74.5 ve %99.1; akciğer örneklerinde %82.7 ve %98.7; akciğer dışı örneklerde %67.2 ve %99.3 olarak hesaplanmıştır. Mikroskobik incelemenin duyarlılık ve özgüllüğü sırasıyla; tüm örneklerde %16.4 ve %99.7; akciğer örneklerinde %28.8 ve %99.2; akciğer dışı örneklerde %5.2 ve %99.9 olarak hesaplanmıştır. Tüm örneklerde ve akciğer ile akciğer dışı örneklerde GX testiyle mikroskobik incelemenin duyarlılıkları arasındaki fark istatistiksel olarak anlamlı bulunmuştur (p<0.001). MGIT SIRE yöntemiyle elde edilen RIF duyarlılık sonuçları referans alındığında, GX testinin RIF direncini saptamadaki duyarlılığı %100, özgüllüğü %95.8 olarak hesaplanmıştır.
TARTIŞMA ve SONUÇ: Sonuç olarak, GX testinin kolay uygulanabilirliği, iki saat içinde doğrudan klinik örnekten MTK DNA’sı ve RIF direncini birlikte saptayabilmesi, mikroskobik incelemeye göre duyarlılığının daha yüksek olması göz önünde bulundurulduğunda TB hızlı tanısında yararlı bir yöntem olduğu sonucuna varılmıştır. Ancak, test sonuçlarının daima kültür yöntemleriyle doğrulanması önerilmektedir.
Comparison of a Rapid Molecular Method with Conventional Methods for Detection of Mycobacterium tuberculosis complex and Rifampicin Resistance
Emre Özkarataş1, Müge Hacer Özkarataş2, Ayşe Aydan Özkütük2, Nuran Esen21Department of Medical Microbiology, Division of Medical Immunology, Cukurova University, Adana, Turkey2Department of Medical Microbiology, Dokuz Eylul University, İzmir, Turkey
INTRODUCTION: In this study, it was aimed to evaluate the performance of GX assay used in the Dokuz Eylul University Hospital Central Laboratory between June 2012 – November 2016 in comparison with microscopy and culture methods for the detection of Mycobacterium tuberculosis complex (MTC) and rifampicin (RIF) resistance.
METHODS: The results of 4199 patient samples (1361 pulmonary and 2838 extrapulmonary) performed with Kinyoun stained microscopy, culture methods and GX test were included to the study.
RESULTS: By using culture as reference method for the detection of MTC; sensitivity and specificity of GX assay were determined as 74.5% and 99.1% for all specimens; 82.7% and 98.7% for pulmonary specimens; 67.2% and 99.3% for extrapulmonary specimens, respectively. The sensitivity and specificity of microscopic examination were found to be 16.4% and 99.7% for all specimens; 28.8% and 99.2% for pulmonary specimens; and 5.2% and 99.9% for extrapulmonary specimens, respectively. The difference between the sensitivities of the GX assay and the microscopic examination was found statistically significant (p <0.001) for all samples and for the pulmonary and extrapulmonary samples. By using the drug susceptibility results of the MGT SIRE as reference method; the sensitivity and specificity of the GX test for detecting RIF resistance was 100% and 95.8%, respectively.
DISCUSSION AND CONCLUSION: In conclusion, GX assay is useful for rapid diagnosis of TB considering that the test is easily applicable and directly detects MTC DNA and resistance to RIF within 2 hours and is superior in sensitivity than microscopic examination. However, test results should always be confirmed by culture methods.
Sorumlu Yazar: Emre Özkarataş, Türkiye
| ARAÇLAR |
 Tam Metin PDF Yazdır Alıntıyı İndir RIS EndNote BibTex Medlars Procite Reference Manager E-Postala Paylaş Yazara e-posta gönder
Benzer makaleler PubMed Google Scholar |