. 2021; 51(1): 33-41 | DOI: 10.5222/TMCD.2020.09226  

Karbapenemaz üreten K. pneumoniae izolatlarının hastanemizde yayılımı: Moleküler tiplendirme ve klonal ilişkinin araştırılması

Reyhan Yiş1, Ebru Demiray Gürbüz2, Ayşe Nur Sarı2, Zeynep Gulay2
1Sağlık Bilimleri Üniversitesi Bozyaka Eğitim ve Araştırma Hastanesi, Tıbbi Mikrobiyoloji, İzmir
2Dokuz Eylül Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji AD, İzmir

GİRİŞ ve AMAÇ: Özellikle son 10 yılda Enterobacterales üyeleri arasında karbapenem direnci artan sıklıkta rapor edilmeye başlanmıştır. Karbapenemaz üreten izolatların taranması ve saptanması, hem tedavinin doğru yönlendirilebilmesi hem de yayılımın önüne geçilebilmesi açısından önem taşımaktadır. Çalışmamızda hastanemiz Mikrobiyoloji laboratuvarına gönderilen örneklerden ardışık olarak soyutlanan karbapenem dirençli K. pneumoniae izolatlarının karbapenemaz tipleri ve moleküler epidemiyolojik ilişkilerinin saptanması amaçlanmıştır.

YÖNTEM ve GEREÇLER: Temmuz- Eylül 2014 tarihleri arasında Mikrobiyoloji laboratuvarına gönderilen örneklerden soyutlanan toplam 32 adet Karbapenem dirençli K. pneumoniae izolatı çalışmaya alındı. İzolatların tür düzeyinde tanımlanması klasik yöntemlere ek olarak BD Phoenix ID/ AST otomatize sistemi ile yapıldı. İzolatların karbapenemaz tipleri (blaOXA-48, blaNDM, blaIMP, blaKPC, blaVIM ve blaGES) PCR ile araştırıldı. İzolatlar arasındaki klonal ilişki PFGE ile değerlendirildi.

BULGULAR: Bulgular: 18 izolatın yoğun bakım ünitelerinden, 9 izolatın servislerden ve 5 izolatın polikliniklerden gönderilen örneklerden izole edildikleri görülmüştür. İzolatların tümünde blaOXA48 geni pozitif olarak saptanmış, diğer karbapenemaz genleri bulunmamıştır. Hastanemizde 32 farklı hastadan üretilen izolatların A-L olarak adlandırılan 12 farklı PFGE pulsotipine sahip olduğu belirlendi. Bunlar arasında en fazla görülenler B (n=18) ve bununla yakın ilişkili B1 paterni (n=2) idi. Geriye kalan izolatlar, birbirinden farklı olan 11 tiple temsil edildi. Salgından sorumlu B pulsotipine sahip ilk izolatın Genel Yoğun Bakım ünitesinden kaynaklanarak yayılım göstermiş olduğu görüldü.
TARTIŞMA ve SONUÇ: Karbapenem dirençli K. pneumoniae izolatlarının hastanede yayılımı muhtemelen gastrointestinal kolonizasyonu olan hastalardan, hastane çalışanları aracılığıyla diğer hastalara izolatların transferi yoluyla gerçekleşmektedir. Bu nedenle aktif sürveyans programları ile kolonizasyonun saptanarak temas izolasyonu ve etkin enfeksiyon kontrol önlemlerinin uygulanması yoluyla hastanelerde izolatların yayılımı sınırlandırılabilir.

Anahtar Kelimeler: Karbapenem dirençli K. pneumoniae, Moleküler tiplendirme, Klonal ilişki


Spread of carbapenemase producing K. pneumoniae isolates in our hospital: Investigation of molecular typing and clonal relationship

Reyhan Yiş1, Ebru Demiray Gürbüz2, Ayşe Nur Sarı2, Zeynep Gulay2
1Ministry of Health University, Bozyaka Training and Research Hospital, Medical Microbiology, Izmir
2Dokuz Eylul University Faculty of Medicine, Medical Microbiology, Izmir

INTRODUCTION: Carbapenem resistance has been reported with increasing frequency among Enterobacterales members, especially in the last 10 years. Screening and detection of carbapenemase-producing isolates is important in terms of both directing the treatment and preventing spread. In our study, it was aimed to determine the carbapenemase types and molecular epidemiological relationships of carbapenem resistant K. pneumoniae isolates, which were isolated sequentially from the samples sent to the Microbiology laboratory.
METHODS: A total of 32 Carbapenem resistant K. pneumoniae isolates isolated from the samples sent to the Microbiology laboratory in the study. Identification of isolates at species level was made with automated system and classical methods. Carbapenemase types of the isolates were investigated by PCR. The clonal relationship between the isolates was evaluated with PFGE.
RESULTS: It was observed that 18 isolates were isolated from intensive care units, 9 isolates from services and 5 isolates from samples sent from polyclinics. The blaOXA48 gene was found to be positive in all of the isolates and other carbapenemase genes were not found.
It was determined that isolates produced from 32 different patients in our hospital had 12 different PFGE pulsotypes called A-L. The most common among these were B and closely related B1 pattern. The remaining isolates were represented by 11 different types.
DISCUSSION AND CONCLUSION: The spread of carbapenem resistant K. pneumoniae isolates in the hospital is probably through the transfer of isolates from patients with gastrointestinal colonization to other patients through hospital staff. Therefore, the spread of isolates in hospitals can be limited by infection control measures.

Keywords: Carbapenem resistant K. pneumoniae, Molecular typing, Clonal Relationship


Reyhan Yiş, Ebru Demiray Gürbüz, Ayşe Nur Sarı, Zeynep Gulay. Spread of carbapenemase producing K. pneumoniae isolates in our hospital: Investigation of molecular typing and clonal relationship. . 2021; 51(1): 33-41

Sorumlu Yazar: Reyhan Yiş, Türkiye


ARAÇLAR
Tam Metin PDF
Yazdır
Alıntıyı İndir
RIS
EndNote
BibTex
Medlars
Procite
Reference Manager
E-Postala
Paylaş
Yazara e-posta gönder

Benzer makaleler
Google Scholar