Analysis Of The ATP8B1 Gene in Progressive Familial Intrahepatic Cholestasis Patients: A Preliminary Report
Ayça Aykut1, Murat Çakır2, Hüseyin Onay1, Deniz Nart3, Çiğdem Arıkan2, Funda Özgenç2, Murat Kılıç4, Funda Yılmaz3, Sema Aydoğdu2, Raşit Vural Yağcı2, Ferda Özkınay1, Özgür Çoğulu11Ege University Faculty Of Medicine Department Of Medical Genetics2Ege University Faculty Of Medicine Department Of Pediatrics
3Ege University Faculty Of Medicine Department Of Pathology
4Ege University Faculty Of Medicine Surgery
OBJECTIVE: Progressive familial intrahepatic cholestasis (PFIC) is a group of rare heterogeneous autosomal recessive disorders characterized by metabolic defects in biliary proteins involved in the formation and transfer of bile acids in the liver. The clinical presentation usually occurs first in childhood with progressive cholestasis, characterized by causing rapidly progressive liver disease. and causing death due to liver failure, there are 3 subtypes. Recent molecular and genetic studies have allowed the identification of genes responsible for three types of PFIC. Molecular genetic testing is essential and conclusive for diagnosis. The aim of the study was to elucidate the role and characteristics of ATP8B1 gene mutations in in 25 patients with progressive intrahepatic cholestasis type 1.
METHODS: The most common mutations seen in the three exons were investigated by DNA sequencing within 27 coding exons.
RESULTS: No mutations identified.
CONCLUSION: Mutation screening of just three exons of the gene revealed difficulty in diagnosis and characterizing the genetic molecular basis of patient with PFIC subtypes. This study was important to understand the genetic background of these cases and further genetic studies needed to provide an another perspective.
Klinik Olarak İlerleyici Ailevi İntrahepatik Kolestaz İle Uyumlu Hastalarda ATP8B1 Mutasyonunun Araştırılması: Ön çalışma
Ayça Aykut1, Murat Çakır2, Hüseyin Onay1, Deniz Nart3, Çiğdem Arıkan2, Funda Özgenç2, Murat Kılıç4, Funda Yılmaz3, Sema Aydoğdu2, Raşit Vural Yağcı2, Ferda Özkınay1, Özgür Çoğulu11Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Genetik Anabilim Dalı2Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Çocuk Sağlığı Ve Hastalıkları Anabilim Dalı
3Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Patoloji Anabilim Dalı
4Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Genel Cerrahi Anabilim Dalı
AMAÇ: İlerleyici ailevi intrahepatik kolestaz (PFIC), karaciğerde safra asitlerinin oluşumu ve transferinde rol oynayan safra proteinlerinin metabolik bozuklukları ile karakterize nadir görülen heterojen, otozomal resesif genetik bir hastalıktır. Hepatosellüler kaynaklı kolestazla seyreden, hızla ilerleyen ve herhangi bir yaşta karaciğer yetmezliğinden dolayı ölüme neden olan çocukluk çağı kolestatik hastalığı olup, 3 alt tipi bulunmaktadır. Son moleküler genetik çalışmalarda PFIC’ in üç tipine neden olabilecek genler saptanmıştır. Moleküler düzeyde tanının tiplendirme yönünden ayırıcılık sağlaması hastanın tanı ve tadavisi için önemli olmaktadır. Bu çalışmadaki amaç klinik olarak ilerleyici ailevi intrahepatik kolestaz tanısı konmuş 25 hastada bu hastalığın en sık görüldüğü tip 1’in oluşumuna neden olan ATP8B1 genindeki mutasyonları araştırmaktır.
YÖNTEMLER: 27 ekzonlu bir gen olan ATP8B1 geninin en sık mutasyonların görüldüğü 3 ekzon DNA dizi analizi ile araştırılmıştır.
BULGULAR: Hastaların taranan ekzonlarında mutasyon saptanmamıştır.
SONUÇ: Yalnızca 3 ekzon taranması, PFIC tip 1’ in genetik nedenini ortaya koymakta zorluk oluşturmasına rağmen, PFIC subtiplerinin ayırıcı tanısının klinik olarak daha ayrıntılı olarak yapılması gerekliliğini göstermektedir. Bu çalışma, bu olguların genetik alt yapısını anlamakta ve ileri genetik incelemeler için başka bir bakış açısı sağlamaktadır.
Corresponding Author: Ayça Aykut, Türkiye
| TOOLS |
 Print Download citation RIS EndNote BibTex Medlars Procite Reference Manager Share with email Share Send email to author
Similar articles Google Scholar |